Septiembre 15, 2008 a 4:38 pm
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- Ne estima cuál debería ser el tamaño de una población ideal, que siga el modelo Fisher-Wright, para que la reducción esperada de la heterocigosis por generación en dicha población ideal y en nuestra población de interés sean iguales.
- Podemos valernos de un “coeficiente de deriva” d = 1/2N en una población F-W para razonar sobre el problema
- Ne en una población que cambia de tamaño resulta de promediar los valores de d a lo largo del tiempo
- Problema: aplicar estos conceptos para mostrar que, cuando el número de hembras (Nf) y machos (Nm) difiere en una población,
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Septiembre 15, 2008 a 4:19 pm
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Un estudio del sistema MN de 1000 súbditos de la Reina de Inglaterra dio los siguientes resultados:
MM 298
MN 489
NN 213
Determinar si la población se encuentra en equilibrio Hardy-Weinberg.
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Septiembre 15, 2008 a 4:09 pm
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Septiembre 1, 2008 a 12:42 pm
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Al inicio de la clase teórica de hoy, lunes 1 de setiembre, se plantearon dos cuestiones para estudiar (no son para entregar):
1- Para la Teoría sintética las mutaciones ocurren “al azar”, ¿en qué sentido?
2- Los mecanismos de defensa inmunológica parecieran ser buenos candidatos a operar de modo lamarckista (herencia de caracteres adquiridos). Investigar el caso.
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Junio 25, 2008 a 1:58 am
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Es la última reunión, por favor leer el artículo de Greenberg y Crow 1960
Material sobre el costo de la sustitución alélica muertes_selectivas
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Junio 16, 2008 a 2:42 am
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Junio 12, 2008 a 12:29 pm
· Archivado en Genética de poblaciones 2008
Aquí van los dos trabajos para estudiar y discutir. Recuerden que el de Greenberg y Crow está comentado en detalle por Gillespie, y que el de McDonald y Kreitman está presentado en un pdf sobre el coalescente repartido oportunamente.
greenbergcrow1960
mcdonaldkreitman-1991-nature-adh-in-droso
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Mayo 29, 2008 a 5:53 pm
· Archivado en Genética de poblaciones 2008
Quedamos en que estudien y hagan los ejercicios del capítulo 3 (Selección natural), secciones 3.1, 3.2, y 3.3.
Por otra parte, Gustavo preparó un resumen de su teórico sobre el coalescente con cambio de tamaño poblacional. Aquí está el pdf. correspondiente:
gustavoguerberof_coalescente_08
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Mayo 23, 2008 a 4:18 pm
· Archivado en Genética de poblaciones 2008
Quedamos en prepararnos para discutir el trabajo de Slatkin y Hudson, en base a las siguientes preguntas-guía (que recomendamos trabajen antes de la clase):
1. ¿Por qué las distribuciones “empíricas” de las frecuencias de diferencias pareadas entre alelos (Figs. 1 y 3) no se acercan a lo “esperado” (Fig. 1)?
2. La distribución de diferencias pareadas (Fig. 5) se acerca razonablemente a una Poisson bajo un modelo de crecimiento exponencial. ¿Qué componentes de la varianza del coalescente estándar deben “desaparecer” (volverse despreciables) para que esto suceda?
3. ¿Cuáles componentes del proceso coalescente estándar afectan las realizaciones particulares de Pi? [Notar que dos de los componentes tienen distribuciones bien conocidas].
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Mayo 15, 2008 a 5:45 pm
· Archivado en Genética de poblaciones 2008
Aquí está el pdf de la presentación usada en la última clase (que a su vez viene del curso 2007):
lessa-aplicaciones-del-coalescente-2007
El siguiente trabajo es para estudiar y discutir en clase:
slatkinhudson1991
El modelo de crecimiento exponencial requiere pasar al coalescente en tiempo continuo. Gustavo dará algunas explicaciones sobre esto en clase. Sin embargo, para entender la tendencia (de qué modo esa desviación del modelo neutral estándar afecta la forma general de la genealogía, que a su vez condiciona el número y distribución de las mutaciones neutrales), pueden referirse a la presentación y a las explicaciones de la clase pasada. La tendencia general no es demasiado diferente si consideramos crecimiento exponencial importante en tiempo continuo o un cambio abrupto importante en una generación en tiempo discreto (esto último fue lo ya comentado en clase).
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