Informamos que hay tiempo de entregar el trabajo final hasta las 17hs del LUNES 30 de noviembre.
Además de entregar una versión impresa del informe, hay que entregar el informe y el alineamiento en versión digital.
Material Curso 2009 (por emergencia en web)
IMPORTANTE
Debido a que la página web del laboratorio esta temporalmente inhabilitada nos hemos visto obligados a colgar el material del curso aquí.
Diapositivas del tema 5
“Deriva genética”: 5a.DerivaGenetica2009
“Mutación. Equilibrios entre mutación y deriva”: 5b.DerivayMutacion2009
“El coalescente”: 5c.El coalescente2009
Calendario: Calendario2009 Programa: Programa2009
Lecturas obligatorias:
Horarios: Horario_practicos_2009
Guia Genética de Poblaciones: GuiaGenPobl2005
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Próximamente más material.
Agenda Darwin 200 – setiembre 2009
Lanzan homenajes a Charles Darwin
El Intendente de Montevideo, Ricardo Ehrlich, asistirá al lanzamiento de las actividades que se realizarán en conmemoración del bicentenario del nacimiento de Charles Darwin y de los 150 años de la publicación de su obra más influyente, el lunes 31 de agosto a la hora 11 en la Salón Aquiles Lanza del Palacio Municipal (Av. 18 de Julio 1360, piso 1 y 1/2). Uruguay será el único país de Sudamérica donde se realizarán actividades del denominado “Año Darwin”. El simposio internacional “150 años de la Teoría de la Evolución de Darwin”, que se realizará en Punta del Este del 3 al 6 de septiembre, y la Escuela Latinoamericana de Evolución, que tendrá lugar en la facultad de Ciencias del 7 al 20 del mismo mes, forman parte de la programación. También habrá una cabalgata reproduciendo el recorrido de Darwin entre Minas y Punta del Este, se emitirá un sello postal y se presentará material para el Plan Ceibal.
Acto inaugural del Simposio Internacional Darwin 200 en Maldonado
El miércoles 2 de setiembre a las 19 hs., en el Hotel Barradas de Punta del Este, se lanza el Simposio Internacional de la serie Darwin 200 en Uruguay, con la presencia del Sr. Presidente de la República, Dr. Tabaré Vázquez, otras autoridades nacionales y destacados científicos de diversas partes del mundo. Ver: http://www.darwin200.edu.uy/schedule.htm
Se inaugura la Primera Escuela Latinoamericana de Evolución
El lunes 7 de setiembre, a las 10:00 hs., se inaugura la Primera Escuela Latinoamericana de Evolución en la Facultad de Ciencias, Iguá 4225 en Malvín Norte, Montevideo. Las conferencias inaugurales estarán a cargo del Dr. Douglas Futuyma (State University of New York-Stony Brook) y Enrique Lessa (Universidad de la República). Por más información sobre esta Escuela, orientada a estudiantes de posgrado de la región, ver http://www.darwin200.edu.uy/elaevo/index.html.
Comienzo de prácticos
Esta semana comienzan los prácticos de evolución. Tener en cuenta:
- Que el primer control de lecturas se realiza en los primeros minutos de cada práctico. Las lecturas y el calendario correspondiente están en la página del curso.
- Que los grupos del jueves de 14 a 16 hs (99) y del viernes de 16 a 18 hs (999) han sido cancelados. Los estudiantes inscriptos en dichos grupos deben cambiarse de grupo. Para ello, dirigirse a los ayudantes y asistentes del curso en el piso 6 de la Facultad de Ciencias lo más pronto posible. Te. 525 8618 int (7) 136 y 143.
Darwin 200 en Uruguay
El año 2009 es un doble aniversario darwiniano, ya que se cumplen 200 años del nacimiento de Carles Darwin (12 de febrero de 1809) y 150 años de la publicación de “El origen de las especies” (24 de noviembre de 1859). En Uruguay habrá diversas actividades conmemorativas de este aniversario, que iremos reseñando en esta página. En particular:
- una serie de actividades de popularización organizadas por el Laboratorio de Evolución de la Facultad de Ciencias, en el marco del proyecto “La evolución biológica o evolución biológica en la cultura moderna, a 150 años de publicación de El origen de las especies“, promovido y financiado por la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII).
Materiales de interés:
E. P. Lessa. 1996. Darwin versus Lamarck. Cuadernos de Marcha, Tercera Época, Año 11, No. 116: 58-64. pdf
En la página del Curso de Evolución de la Facultad de Ciencias hay material en español sobre el tema. Iremos ofreciendo más material a lo largo del año…
La Society for the Study of Evolution (que ha contribuido fondos complementarios para nuestro proyecto de popularización mencionado más arriba), ha iniciado una página con motivo de este aniversario, que irá creciendo a lo largo del año:
Información general de exámenes
Se pone a disposición este medio para consultar dudas puntuales.
Recordamos que hay disponible una guía para los exámenes: http://evolucion.fcien.edu.uy/evolucion.htm
Además, sobre la fecha de cada examen se organiza una clase de consulta. En general, se hace dos días hábiles antes del examen, pero siempre conviene verificar fecha y hora. Esa información se publica en el blog o en carteles en el piso 6 de Facultad.
También por lo general, nos juntamos en el hall del piso 6 y, según la cantidad de gente, bajamos a algún salón de clase.
Hola, estamos trabajando con canidae, con el citocromo b. En la gran mayoria de las especies la cantidad de bases es de aproximadamente 380. No nos damos cuenta que criterio usar para saber si esa cantidad es suficiente para el estudio filogenetico (1), o si deberíamos usar un gen cuya cantidad de bases sea mayor (2). Sospechamos que no ya que se trata de un gen mitocondrial entonces no haría falta, pues esa cantidad sería suficiente para estudiar divergencias ya que denotan una diferenciación adecuada para ello (3), pero no estamos seguros, gracias, saludo
Fernando,
1) La cantidad de pares de bases (información) mínima en la secuencia depende de las relaciones filogenéticas que quieras reconstruir, cuanto mas información mejor.
2) El gen del cotocromo b, que se encuentra en el genoma mitocondrial, consta de aprox. 1140pb., es un gen muy utilizado como marcador para reconstrucciones filogeneticas, ergo esta muy representado en el genbank. Creo entonces que harbía que buscar mejor, hay muchos genes completos. Si queres proba agregar en la búsqueda “complete cds” o date una vuelta por el 6to y te enseño una forma muy sencilla de sacar genes de genomas mitocondriales completos.
3) ¿Como te das cuenta que “denotan una diferenciación adecuada para estudiar divergencias”?, eso tendríamos que charlarlo personalmente. (6to piso)
Andrés I.
Ejercicio Ne y θ
El parámetro poblacional neutral θ se define, para un sistema diploide autosómico como 4Nµ. Esto puede entenderse como 2 x 2N x µ, siendo 2N el número efectivo de “genes” (alelos) en la población. Sobre esta base, completar la siguiente tabla:
|
Sistema |
número efectivo de genes |
θ |
|
diploide autosómico |
2N |
4Nµ |
|
mitocondrial |
|
|
|
cromosoma Y |
|
|
|
cromosoma X |
|
|
Ejercicio Hdm vs He
Considerando que
- HDM es la heterocigosis esperada en equilibrio entre deriva y mutación bajo neutralidad
- HE (= HHW) es la frecuencia de heterocigotas esperada en equilibrio Hardy-Weinberg, que puede contrastarse con la observada Ho en un caso de estudio
Pensar sobre la siguiente observación:
- para un sistema diploide, HDM y HE (= HHW) son casi iguales
Ejercicio Ne
- Ne estima cuál debería ser el tamaño de una población ideal, que siga el modelo Fisher-Wright, para que la reducción esperada de la heterocigosis por generación en dicha población ideal y en nuestra población de interés sean iguales.
- Podemos valernos de un “coeficiente de deriva” d = 1/2N en una población F-W para razonar sobre el problema
- Ne en una población que cambia de tamaño resulta de promediar los valores de d a lo largo del tiempo
- Problema: aplicar estos conceptos para mostrar que, cuando el número de hembras (Nf) y machos (Nm) difiere en una población,
